各種果物は圧搾を経て得られた汁は、初搾り粗ろ過により多くの雑誌が含まれているため、汁は比較的に濁っており、初搾り汁に対して浄化処理を行う必要があり、この場合は果汁分離機を用いて、高速遠心分離後にその中の固体不純物と懸濁物を除去することができ、果汁は澄みきった清浄化処理を行った後、より透明で清らかである。

果汁分離機の運転時、果汁は果汁分離機のホッパからスクリューフィーダの低いところに連続的に送られた後、果実のスラリーは下から上に送られ、一定の傾斜角度を持っている。螺旋のピッチは大きく徐々に縮小され、わずかな圧搾作用を果たす。だから果汁はふるい網を経て底部槽に流出し、ポンプを経て発酵容器に送られた。このように汁を連続的に送り込むと、自流汁が連続的に流出するので、果汁分離機と呼ばれている。